內地武漢市爆發不明肺炎，香港兩宗懷疑個案的病人，分別一度自行到深圳求醫、違反醫療建議自行出院。食物及衞生局局長陳肇始周一根據「對公共衞生有重要性的新型傳染病準備及應變計劃」，召開嚴重應變級別督導委員會會議，與多個相關政策局和部門討論防控措施。當中提及將全速修訂《預防及控制疾病條例》（第599章）的工作，把嚴重新型傳染性病原體呼吸系統病納入為法定須呈報的傳染病，預計在本周內刊登憲報。新型傳染病現時並非《預防及控制疾病條例》所指明須呈報傳染病，故目前如懷疑個案病人拒絕接受隔離或進行檢疫，衛生署並無法定權力處理。
截至周一中午12時，公立醫院於過去24小時共接收6名曾於過去14天到訪過武漢，並出現發燒、呼吸道感染或肺炎徵狀的病人，當中包括一名曾向私家醫生求診的男病人，及一名曾到私家醫院求診的女病人。6名病人年齡介乎2至65歲，包括一名2歲男嬰及一名5歲女嬰。6人分別於基督教聯合醫院、伊利沙伯醫院、大埔那打素醫院、威爾斯親王醫院、屯門醫院留醫。
醫管局已向衞生署呈報有關個案及已將病人樣本送交化驗。有關病人現正接受隔離治療。醫管局總感染控制主任賴偉文醫生說︰「有關病人於病發前並沒有到過武漢的濕街市，所有人現時情況穩定，醫管局會繼續監察有關病人的情況及提供合適治療。」連同上述個案在內，公立醫院自2019年12月31日起，共向衞生署呈報21宗相關病人個案，其中7人已經出院。
中文大學周一開始第二學期，中大和聲書院學生會及「和聲十大基建」facebook專頁周一晚指，南座9樓有2名內地女宿生由白車送院，兩人12月中到過武漢，分別在1月2日及3日返港。其中一位女同學並無感染症狀，另一位女同學有咳嗽、岀現上呼吸道感染病徵，並無發燒。兩人經醫生檢查後已出院，據報有病徵的同學非於14天內到武漢故不符合監測條件。學生會指高度關注事件，已要求院方盡快徹底清潔南座9樓、消毒南座升降機及大堂等地方。
中大一名曾到武漢的內地女生周日不適，該女生曾到私家仁安醫院求診，其後一度到深圳求醫，周一於威爾斯親王醫院留醫，曾發燒及有上呼吸道感染徵狀。她在12月29日返港，周六（1月4日）感到身體不適。有報道指，該中大女生對腺病毒及OC43冠狀病毒呈陽性反應，不涉武漢不明肺炎。女生所住的中大伯利衡宿舍已加強清潔。
律敦治醫院周日接獲一名45歲內地女子，由武漢來港後發燒的個案，她1月4日以遊客身分從武漢抵港，翌日到律敦治醫院求醫，周一晚違反醫療建議自行出院。據報她入院時發燒、嚴重咳嗽、肺部左下方有陰影，入院後被送到隔離病房。醫管局表示，該病人留院監察期間並無發燒或肺炎徵狀，情況穩定。她於入院當晚要求離院，醫院考慮病人臨牀情況及其快速測試對一般病毒（包括流感）呈陰性反應，醫護人員告知病人相關醫療建議及風險。在諮詢衛生署的意見後，醫院提供離院資訊予該自行出院病人。
武漢《長江日報》訪問武漢市疾病預防控制中心主任李剛，被問到病例數量增加，他指在全市醫療機構開展相關病例搜索和回顧性調查，搜索範圍擴大，對現有病例的回顧性調查進一步深入，對納入監測病例排查的持續開展，是患者數量增加的主要原因，預計隨著相關工作開展，病例數量還會有所增加。
李剛說，不明肺炎多例與華南海鮮城有關聯，進一步調查顯示，患者臨床上多有發熱、乏力，部分患者有咳嗽、少痰，一小部分患者隨着病情進展出現呼吸困難；發病早期白細胞總數正常或減低，淋巴細胞計數減低，部分患者出現肝酶和肌酶增高；胸部影像學檢查顯示雙肺彌漫性毛玻璃樣滲出影。患者上述情況提示為病毒性肺炎表現。
李剛表示，截至目前，已排除流感、禽流感、腺病毒、傳染性非典型肺炎（SARS）和中東呼吸綜合症（MERS）等呼吸道病原。病原鑒定和病因溯源工作仍在進一步進行中，尚未發現明確的人傳人證據。但是患者臨床表現為病毒性肺炎，有重症病例。至於如何預防，李剛說，普通的病毒性肺炎，一年四季均可發生，對於這次不明原因的病毒性肺炎，武漢市已採取關閉華南海鮮市場、患者隔離治療、密切接觸者追蹤和醫學觀察等防控措施。但冬春季節是病毒性肺炎等呼吸道傳染病的高發季節，公眾需要保持良好的生活和衛生習慣，勤洗手，保持室內空氣流通，適當開窗通風，接種流感疫苗等。此外，避免到封閉、空氣不流通的公眾場合和人多集中地方，必要時佩戴口罩等。
