香港絕大部分蔬果都是進口,不過,申訴專員主動調查食環署對進口蔬果安全的檢測制度後,發現文錦渡辦事處抽驗陸路入口蔬果的做法不善,食環署員工一般只抽取貨車貯物櫃近櫃門的蔬菜,放在車廂位置較入的蔬菜可輕易避過檢測,而經海路及空運進口的蔬果,大部份未經檢驗已流入市面,經空運進口或在零售層面被抽檢的蔬果,化驗期更長達19天。申訴專員批評食環署未有做好「上游」把關工作。
按照食環署的風險評估,蔬菜及水果並不屬於「高危」食物,進口無須預先得到食環署准許。食安中心現行的做法,是在蔬果剛到港時,以及在批發和零售層面進行抽驗。

申訴專員發現,文錦渡辦事處對陸路進口的蔬菜貨車抽檢程序急速,食環署的外判工人,只會提取貨車內近門的幾箱蔬菜作檢測,位置較入的蔬菜可輕易避過檢測。部分水果也會經文錦渡入口,但申訴專員指,運載水果的貨車較少主動駛入文錦渡辦事處供抽檢。申訴專員批評,食環署職員有權截查該等水果貨車,卻鮮有這樣做,對水果檢測的檢測過於鬆懈。
至於海路入口的蔬果,食安中心於葵涌貨櫃碼頭海關大樓設食物檢查站,惟食安中心卻指蔬果不屬高危食物,而且大部分進口蔬果須保持冷凍,食物檢查站卻無冷凍設備,故食物檢查站並無恆常抽查蔬菜,只會在接獲情報、鄰近地區有食物安全事故等「有需要時」,才會在站內做抽檢。
申訴專員批評,食安中心對海路入口的蔬果,主要在批發及零售層面抽檢,而非在蔬菜剛入境時,而且批發及零售層面的抽檢並非針對海路進口蔬果,而是涵蓋海陸空入口,檢測期更長達19個工作天,故大部分海路入口的蔬果,實質是未經檢測已流入市面,情況有欠理想。
空運入口的蔬果由食安中心的機場辦事處抽檢化驗,除非有食物事故或緊急情況,會於兩個工作天內完成化驗,其餘一般需時19個工作天,同樣該些蔬果很可能已流入市面。申訴專員形容情況令人擔憂。
食安中心回應,食環署人員在文錦渡抽取蔬菜檢查時,除了抽取近貨車門的蔬菜外,亦有按需要抽取放在貨車較高及較後的蔬菜。此外,中心已主動加強從進口商貨倉抽取海路進口的水果檢測,亦會加強從批發市場抽取水果樣本。中心表示,香港出售的蔬果種類及數量繁多,大比例地檢測蔬果並不切實可行,蔬果樣本佔每年檢測食物總數相當高的比例。